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En los últimos ańos, los estudios del proteoma del plasma seminal han permitido identificar proteínas específicas en toros de alta y baja fecundación, de tal manera que algunas de ellas puedan emplearse como bio-marcadoras de fecundación. En este sentido el presente estudio de las proteínas del plasma seminal asociadas con calidad espermática, fecundación y desarrollo embrionario del ganado criollo San Martinero sobresaliente por sus mejores índices reproductivos (fecundación, natalidad, intervalo entre partos) al inicio de su etapa reproductiva, comparadas entre la época seca y lluviosa y con la raza Cebú Brahman de mayor población en el trópico bajo Colombiano, generó la primera información base por raza y por época, sobre mapas electroforéticos uni y bidimensional de puntos de proteínas del plasma seminal referenciales y, mediante modelos de predicción, seńaló y resaltó la acción de los posibles puntos de proteínas en forma de clúster que podrían estar generando efecto sobre los indicadores de eficiencia reproductiva. De igual forma permitió seleccionar algunos puntos que posiblemente están asociadas con los toros de mayor y menor fecundación.