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L'explosion des données et des sources de données sur le Web nécessite des solutions d'intégration pour de nombreuses applications dans divers domaines. En parallčle, les ontologies ont été largement développées. Par conséquent, un grand nombre d'instances ontologiques ont été générées. Nous avons proposé un systčme d'intégration complet pour les sources ŕ base ontologique permettant une intégration automatique, une grande autonomie des sources et une réconciliation et fusion des instances. Notre systčme permet une flexibilité de l'ajout d'une nouvelle source et peut ętre utilisé ŕ grande échelle. Il traite l'hétérogénéité par des ontologies enrichies par les dépendances fonctionnelles (DF) définies sur chaque classe ontologique. Ces DF permettent la réconciliation des données tout en relâchant la contrainte d'existence d'un identifiant commun. Nous avons doté notre systčme d'une méthode complčte de réconciliation et de fusion de données. Elle se déroule suivant cinq étapes: (1) découverte des DF de la requęte, (2) détermination des sources concernées, (3) dérivation de la clé de réconciliation, (4) évaluation des requętes et enfin, la (5) réconciliation et fusion des résultats.